微流控实验过程中，某些时候会对微流控芯片进行加热，或者维持芯片在一定的温度下。由于微流控芯片通道的深度通常从10μm到500μm之间，因此，微流控芯片即使在没有任何遮蔽的情况下，芯片通道内的温度也可以做到非常均匀，因此，单纯的对芯片整体加热，可以直接把芯片放在加热器上。
在用温度控制器对芯片进行整体加热时，需要考虑芯片的耐温，也就是当温度控制器设定到较高温度时，芯片在长时间使用下而不会有漏气漏液现象或者不会有破裂现象。因此，对微流控芯片加热，低温加热通常是室温到50℃。这类温度加热适用于PDMS芯片。对于玻璃芯片，承受的加热温度会更高一些，可以做到150℃到200℃，具体取决于玻璃材质和键合工艺。
如果是对微流控芯片通道内的某一段区域进行加热，那么就需要在通道的局部区域位置加工加热电极，然后连接温度控制器，从而实现局部区域的液体加热，这种加热方式叫为局部加热，不同于芯片的整体加热。局部加热需要在加工芯片的过程中，提前加工加热电极。此外，这种局部加热方式可以精确控制局部液体的加热温度，实现定区域加热，对于某些实验来讲是非常有利的。从当前的微加工技术来看，完全可以实现局部加热。
实验室内对微流控芯片加热，除了采用温度控制器外，还可以使用水浴锅、细胞培养箱、加热套等方式实现微流体导管内的液体在一个恒定的温度下。这种加热方式，通常需要结合实验室已有的器材。这需要有很强的动手能力和灵活解决问题的能力。
在选择温度控制器时，需要关注控制器的温度范围、准确度、稳定性、加热器的体积大小以及是否可编程等。自行搭配温度加热系统时，可以从温度加热器、温度控制器和温度传感器三个方面，并结合所需要的加热温度范围、温度准确度、温度稳定性、外形尺寸等进行选择。
泰初科技提供2种类型的温度控制器：通用版和可编程版本。无论是通用版还是可编程版本，都会用到加热器和温度传感器，这里介绍两种透明的加热玻璃。
均匀加热玻璃板（Techu-HP75×65）–适用于立体、正置显微镜和倒置显微镜的长距离物镜
● 允许您在 80x70mm 的玻璃表面上加热样品。
● 具有较大的75x65mm光学窗口。
● 加热玻璃板提供较薄的轮廓外形和均匀的加热表面。
● 内置温度传感器。
● 平坦的玻璃顶面采用 128x86mm 安装框架（5mm 厚）。 框架是标准多孔板的大小，适合大多数显微镜载物台。
● 可用于加热板、烧瓶、载玻片和培养皿。 开放式或密封容器可以直接在清洁的表面上形成，例如使用自粘垫圈。
● 可能需要显微镜适配器（订购时指定显微镜型号）。
● 可以升级物镜加热器
● 需要温度控制器。
| 光学窗口 | 75×65mm |
| 外形尺寸 | 128x86x5mm |
| 玻璃厚度 | 1mm |
| 温度稳定性 | 0.01℃，敏感应用需要：纳米/压电定位，例如共焦成像。 |
均匀加热石英板（Techu-HPQ75×50）
● 用于在紫外或近红外照明范围内工作的熔融石英（1.1 毫米厚），而不能使用普通玻璃（因为它在这些照明波长范围内不透明）。
● 可以承受高温应用而不会开裂。允许您在 75x50mm表面上加热样品。
● 较大的70x45mm光学窗口。
● 加热石英板提供薄型的外形轮廓和均匀加热表面。
● 内置温度传感器。
● 平坦的玻璃顶面采用 128x86mm 安装框架（5mm 厚）。 框架是标准多孔板的大小，适合大多数显微镜载物台。 开放式或密封室可以直接在清洁的表面上形成，例如使用自粘垫圈。
● 可能需要显微镜适配器（订购时指定显微镜型号）。
● 可以升级物镜加热器
● 需要温度控制器
| 光学窗口 | 70×45mm |
| 外形尺寸 | 128x86x5mm |
| 玻璃厚度 | 1.1mm |
| 温度稳定性 | 0.01℃，敏感应用需要：纳米/压电定位，例如共焦成像。 |
可编程2通道精密温度控制器Techu-TC2-80/150
可与温控显微镜载物台一起使用。提供某些敏感应用所需的更高稳定性，例如纳米/压电定位、AFM成像。通过触摸屏进行灵活控制，易于使用。可以编程高达4个步骤或斜坡的温度曲线（如果只使用一个通道，则为8个步骤）。
可编程的温度控制输入
● 由于高稳定性，无漂移，0.01℃；
● 成像和记录期间无振动-内部无风扇
● 塑料封装的外部探测器：没有金属离子泄露到溶液中
● 自动冷却
● 自动调整温度，无需手动调节；
● 多个温度传感器可供选择，用于反馈、样品台和水浴的温度控制；
● 内置过热保护
● 可编程温度变化的控制
● 用于监控和设置温度的模拟和数字输出，RS232端口；
● 用于软件控制的数字接口
● 无电噪声-适用于电生理学
| 温度范围 | -80到150℃，准确度0.1℃ |
| 稳定性 | 0.01℃ |
| 内置温度传感器 | 加热台包含传感器以实现稳定运行 |
| 外部温度探测器 | 微型0.87mm直径，适合小体积腔室。 |
| 设置 | 自动调节以实现对不同的样品体积和加热台尺寸的温度稳定；无需手动调节；外部输入自定义的温度控制协议；软件控制。 |
| 反馈 | 来自内置的样品台或水浴传感器 |
| 外形尺寸 | 14×6×8英寸 |
| 输入/输出 | 每通道100-240VAC，230W/8A，230W（带35V输出）。 |